Вищим органом управління ГС «Асоціація «Гідроенергетика України» є Загальні збори членів Асоціації.
Загальні збори членів Асоціації мають право приймати рішення з будь-яких питань діяльності Асоціації.
До виключної компетенції Загальних зборів членів Асоціації належить прийняття рішень з таких питань:
˗ визначення основних напрямків статутної діяльності Асоціації;
˗ розгляд і затвердження довгострокових програм діяльності Асоціації;
˗ затвердження Статуту Асоціації та змін і доповнень до нього;
˗ прийняття рішення про припинення діяльності Асоціації, призначення ліквідаційної комісії (ліквідатора);
˗ прийняття рішення про обрання та відкликання Президента Асоціації, Віце- президентів Асоціації та інших членів Президії Асоціації;
– затвердження річного фінансового плану (бюджету) Асоціації;
– обрання та відкликання Голови і членів Ревізійної комісії Асоціації;
– прийняття і затвердження Положень про Президію Асоціації та Ревізійну комісію Асоціації;
˗ розгляд та затвердження звітів про свою діяльність Президента, Президії Асоціації та її Ревізійної комісії;
– прийняття рішення про заснування Асоціацією інших юридичних осіб (підприємств, організацій) з метою здійснення ними господарсько-фінансової діяльності в інтересах Асоціації та у відповідності до цілей та напрямків її діяльності;
– прийняття рішення про відчуження майна Асоціації на суму, що становить 50 (п’ятдесят) і більше відсотків майна Асоціації або про встановлення обтяжень на таке майно.
Повноваження з вирішення питань, що не відносяться до виключної компетенції Загальних зборів членів Асоціації делегуються Президії Асоціації.